La prise en charge médicamenteuse de la migraine est de deux types :
 le traitement de la crise : pris en début de crise, il a pour objectif de diminuer la douleur et les signes associés (en particulier les troubles digestifs),
 le traitement de fond : pris en continu sur une période longue, il vise à rendre le migraineux moins sensible aux facteurs déclenchants, à réduire la fréquence, l'intensité et la durée des crises, et à améliorer la réponse au traitement de crise.